包涵体（inclusion bodies），或包含体，是无定形的蛋白质的聚集，不被任何膜所包围。细胞破碎后，包涵体呈颗粒状，致密，低速离心就可以沉淀。包涵体难溶于水中，在变性剂溶液（如盐酸胍、脲）中才能溶解。在这些溶液中，溶解的蛋白质呈变性状态，即所有的氢键、疏水键全被破坏，疏水侧链完全暴露，但一级结构和共价键不被破坏。因此当除去变性剂时，一部分蛋白质可以自动折叠成具有活性的正确构型，这一折叠过程称为蛋白质的复性。

包涵体主要由蛋白质构成，其中大多是基因表达产物。这些基因表达产物没有生物活性。为此，欲获得天然活性态的目标产物，必需分离包涵体后，溶解包涵体并使其中的目标蛋白恢复应有的天然活性。所以，包涵体的出现不仅增加了生化工程师生物分离设计的难度，也为生物化学家的蛋白质折叠（protein folding）机理研究提出了新的课题。

Inclusion bodies, sometimes called elementary bodies, are nuclear or cytoplasmic aggregates of stainable substances, usually proteins. They typically represent sites of viral multiplication in a bacterium or a eukaryotic cell and usually consist of viral capsid proteins. Inclusion bodies can also be hallmarks of genetic diseases, as in the case of Neuronal Inclusion bodies in disorders like frontotemporal dementia and Parkinson's disease.