同源异形基因（英语：Hox genes）是生物体中一类专门调控生物形体的基因，一旦这些基因发生突变，就会使身体的一部分变形。其作用机制，主要是调控其他有关于细胞分裂、纺锤体方向，以及硬毛、附肢等部位发育的基因。Hox基因属于同源框家族的其中一员，在大多数Hox基因中，会含有一段约180个核苷酸的同源异型盒，可以转录出含有约60个氨基酸串行，称为同源异形域。

Hox基因的特色之一，是其排列顺序与其作用顺序、作用位置相关，例如位在较靠近3'端（DNA的其中一端）的基因，作用的位置较靠近头部。而且动物界中的成员，皆拥有类似的Hox基因排列方式、产物与作用方式。Hox基因对于动物型态的影响，能使演化生物学研究得到关于型态转变的线索。

Hox genes (a subset of homeotic genes) are a group of related genes that control the body plan of an embryo along the cranio-caudal (head-tail) axis. After the embryonic segments have formed, the Hox proteins determine the type of segment structures (e.g. legs, antennae, and wings in fruit flies or the different types of vertebrae in humans) that will form on a given segment. Hox proteins thus confer segmental identity, but do not form the actual segments themselves.